Lagu Sekolah Menengah Sains Kuching Utara telah digubah lirik dan lagunya oleh guru Pendidikan Muzik, En. Ernie Juan Prima bin Nordin dan guru Pendidikan Seni Visual, En. Berudi ak. Ngelambai. Lagu ini berjudul 'MEKAR SAKURA' yang melambangkan kecemerlangan SAKURA juga setanding dan seiring dengan SBP lain di seluruh Malaysia. Lagu 'MEKAR SAKURA' telah dirasmikan pada 22 Mei 2013 oleh Pengetua, Dr. Norisah bt. Hj. Suhaili.

MEKAR SAKURA

(Dengarkan lagu di sini)

Di sini

Kita mengorak langkah

Dalam usaha mencapai cita-cita

Menjadi insan yang cemerlang

Demi masa depan yang gemilang

Di sini

Ikrar kita laungkan

Cogan kata seiring dibawa

Ilmu, Integriti, Iltizam

Teras kemajuan kita bersama

Sekolah Menengah Sains Kuching Utara

Namamu dijulang sentiasa

Menjadi kebanggaan kita semua

Untuk agama, bangsa dan negara

Maju sehati, (maju sehati), maju sejiwa

Perpaduan menjadi pegangan

Agar kita terus berjaya

Harumlah namamu SAKURA

Harumlah..... Namamu SAKURA.....